Het ESV wordt bestuurd door een bestuurscomité van vier personen. NIRAS en het SCK.CEN duiden ieder 2 bestuursleden. Deze worden door de Algemene Vergadering van de Leden aangesteld voor een periode van 3 jaar. De voorzitter van het bestuurscomité wordt aangeduid door NIRAS.   De secretaris en de directeur nemen deel aan de vergaderingen van het bestuurscomité met raadgevende stem.